مجلس دانش آموزی با مدیریت سازمان دانش آموز ی است که منتخبین شورا در یک پروسه زمانی دوساله انتخاب شده و به عنوان مشاورین مدیرکل  آموزش و پرورش استان منصوب و نقش مشورتی دارند. علوه بر این دانش آموزان مجلس در جلساتی منظم در قالب مجلس دانش آموزی برگزار می کنند و طرح و لوایح پیشنهادی خود را به مسئولین آموزش و پرورش ارئه می دهند. در واقع مجلس دانش آموزی یک نهاد صنفی و مشورتی و پل میان قشر دانش آموز و مدیران تصمیم گیرنده در دستگاه آموزش و پرورش کشور است.

این دانش آموزان منتخب نشست هایی را سالیانه دارند و در این نشست ها مباحث مربوط به کلاس درس و محیط آموزش و پرورش را ایده پردازی می کنند و با انجام تحقیق به نقد مسائل می پردازند و پیشنهاداتی را اعلام می کنند.